稳定的生态有机肥发酵菌剂是制造优质生态有机肥的关键 ，生产生态有机肥包括菌剂生产 、肥料制造和产品检验包装等工序过程 ，其中菌剂生产尤其重要 ，它包括菌种选育 、菌剂发酵、质量检测、包装与贮存和运输等环节，技术水平要求高，对下游生产肥料质量影响很大 ，是生产生态有机肥的关键 ，需严格把关 ，严格控制 ， 应集中技术力量强的企业专门生产 ，以有利于保证菌剂质量和产品更新开发。

传统采用堆肥 、沤肥等方法生产有机肥料技术粗放 ，利用肥料中原有微生物自然接种 ，露天堆沤 ，基本为有机质腐烂过程 ，其周期较长如一般秸秆堆肥需 1～2个月，且不具有其他生态肥效。而采用人工接种快速堆肥菌剂堆制
秸秆肥料可快速腐熟 ，20d左右即可达传统堆肥腐熟程度 ，且施人土壤后具有肥效和 固 N、解 P、解 K及改善生态环境等功效 ，因此用于生产生态有机肥的菌剂质量十分重要。我国过去推广应用生物肥料几起几落 ，其主要原因是受菌剂质量问题所限。要保证菌剂质量一是要选择具有优 良特性的菌种，保证菌种生产过程中不衰退 、不混杂。菌种衰退是由量变到质变的演变过程 ，开始群体中只有个别细胞发生负变或混杂少数杂菌 ，这时若不及时采取有效措施，而一味继续移接转代 ，则群体中这种负变细胞或混杂菌 比例逐步增高并 终 占优势，从而使整个群体表现出严重衰退 ，使菌剂失效 ；二是要采用合适菌剂生产工艺 ，此类菌剂生产一般是多菌种混合发酵过程 ，各种菌群比例和生长量必须通过适 当营养配方、适宜培养条件和先进的工艺流程加以控制 ，因此需要集中生产和科学管理。